山陀兒颱風挾帶大量豪雨，不少縣市傳出災情，但總統賴清德、內政部長劉世芳主持中央災害應變中心工作會報時，曾點名基隆、花蓮等藍營執政縣市救災作為未到位，遭批「對藍營縣市吹毛求疵」。中央災害應變中心今（6）日說明，從凱米颱風至山陀兒颱風的整備作業SOP都相同，以確保民眾生命財產安全為目標，完全沒政治考量。
中央災害應變中心表示，山陀兒來襲時洽逢多次花蓮地震，連續降雨及風大雨大可能發生的致命性災害，土石流、大規模崩塌、淹水造成「孤島」狀況，因此預防性撤離更是重中之重。
中央災害應變中心指出，面對地質不穩定等產生的潛在風險，由於不希望出現臨時強制撤離的危險狀況，才會積極提醒花蓮縣政府確認預防性撤離人數已達3,067人、也同時修正其保全戶人數為5,082人，澄清說明其中人數差距在於「有設籍但人不在者。」
應變中心進一步指出，基隆市在山陀兒颱風解除警報後的超大豪雨，仍然發生新豐街大規模土石崩塌、部分社區被滑落土石侵入等危險狀況，經多次提醒，從10月3日下午起陸續撤離116人；新北市金山、萬里淹水災情亦非常嚴重，顯示東北角災害不因山陀兒解除而馬上停止，也因此中央災害應變中心仍然維持開設至今日。
應變中心強調，總統賴清德、行政院長卓榮泰時時提醒天災不可抗力，但避災、防災、減災、離災先於救災救護，保守生命安全保護財產，是政府的責任，沒有中央地方之分。因應山陀兒颱風災害，不論中央、地方的第一線同仁都盡忠職守，異常辛苦守在前線，無非就是為了保全災區大眾的生命安全為首要，不分任何政治立場，且工作會報過程也都以公開透明的直播方式讓社會的每個人來檢視。
應變中心說明，目前山陀兒颱風警報雖已解除，但因災害復原仍維持二級開設，尤其是國防部、經濟部、交通部、農業部、衛福部、環境部、通傳會、消防署、國土署、台電、台水等單位持續進駐；也非常感謝台北、新北、桃園、竹市、台中、嘉縣、台南等縣市政府在接獲國土署、消防署通報後，立刻支援調度重機具協助高雄、基隆市的復原清理市容工作。
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